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PCR体系溶剂蒸发原因分析

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在PCR实验中,我们逐一盖好管盖或小心翼翼封膜后,在经过(30~40)次循环、90min左右的等待后,当取出PCR管时,有时会发现某些PCR管内体系明显减少,甚至干掉了,这难免让人沮丧又疑惑:前面做的没啥问题哈,这是为啥呢!

 

在PCR实验中,试剂蒸发的现象其实较为常见,循环中体系溶液在高温(95℃左右)下气化,在热盖(默认105℃)的保护下,可以防止水汽在管盖上凝结,但还是会有蒸汽存在于管中,当管盖或覆膜密封不严时,溶液自然会蒸发出去,在反应体系只有几微升时,溶液的挥发影响更大。究其原因主要有以下三点。

1)PCR管

PCR板通常为PP聚丙烯材质,为保证热传导效率,管壁都比较薄,PP的热膨胀系数是热模块的数倍,在热循环中会不断受热、膨胀、变形,当形变严重到影响热盖与管盖的接触时,会引起 PCR 孔板泄漏、溶液蒸发。

市面上PCR仪多种多样,而配套的PCR管(单管、八联管、96孔板等)又是多种多样,很难说相互间的适配性是一定可以得到保证的。性能良好的PCR管可以做到10%的溶剂蒸发率,甚至是3%。尺寸的影响也很明显,PCR管长短不一会出问题,有的PCR管热盖压力不足、管内蒸汽过多会溢出,有的PCR管会被压弯跑完PCR之后会发现管子被压弯变形。

2)人为因素

压盖或封膜时的操作及检查。

对于PCR管盖:压紧管盖后,用指甲盖轻挑一下管盖,如果很轻易挑出缝隙,说明PCR管自身的匹配就不好、密封不严,后续PCR仪热盖压再紧也是于事无补的;而对于封膜,膜本身的材质、厚度、平整度等都会有影响,另外也需要检查确认每个孔位周围的封膜,无褶皱和卷曲等。

PCR循环反应条件的设置。

PCR仪目前大都需手动输入体系的体积,仪器用于模拟控温,当输入体积远高于实际体积时,温度过冲和热平衡时间会加大,高温段停留时间的延长无疑会增加溶液泄漏的风险。

 

3)PCR仪热盖

我们以当前常见的可调节式热盖和自适应式热盖说明。可调节式热盖,即热盖高度可以手工调节,便于适配不同的PCR管,但需凭经验手拧调节压力,拧不紧管内溶液会蒸发,拧得过紧也会压坏管子而导致溶液蒸发。其中的力矩式可调热盖则好一些,热盖旋转到一定力矩后会打滑、发出“咔咔”声,热盖的压力可以保持一定。

 

 

自适应式热盖,即热盖自带预压紧的弹簧机构,通过与热盖手柄相结合,在压手柄时可以自动压紧热盖,开手柄时自动松开热盖,对于PCR管的适配性较好。

简而言之,当PCR实验中遇到体系蒸发的现象时,建议还是先检查下自己的操作有无问题,所采用的PCR管耗材有无质量问题,再去排查仪器热盖的压紧力度。

 

2024年5月8日 10:38
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